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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_109345
Cell Name :  4_S5_C1z-ims
Archive Name :  Huang_JY
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J + FVB
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  TrkA LOF
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2018-10-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  4_S5_C1z-ims.pvec
Note :  Nex-Cre carrier with IUE overexpression

Reference Article
Related Article Reference :  mGluR5 Tunes NGF/TrkA Signaling to Orient Spiny Stellate Neuron Dendrites Toward Thalamocortical Axons During Whisker-Barrel Map Formation.

Measurements
Soma Surface :  12.17 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  25
Overall Width :  62.07 μm
Overall Height :  45.79 μm
Overall Depth :  25.38 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  426.11 μm
Total Surface :  334.66 μm2
Total Volume :  20.92 μm3
Max Euclidean Distance :  56.05 μm
Max Path Distance :  65.8 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  575
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  81°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.56°
Fractal Dimension :  1.02

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