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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117393
Cell Name :  4_54
Archive Name :  Banerjee
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Effective RNF2 RNAi
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-06-10
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  4_54.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Modulation of hippocampal synapse maturation by activity-regulated E3 ligase via non-canonical pathway.

Measurements
Soma Surface :  932.56 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  126
Number of Branches :  258
Overall Width :  50.7 μm
Overall Height :  107.08 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.23 μm
Total Length :  1033.78 μm
Total Surface :  2356.71 μm2
Total Volume :  2552.27 μm3
Max Euclidean Distance :  99.88 μm
Max Path Distance :  131.52 μm
Max Branch Order :  51
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  4395
Partition Asymmetry :  0.71
Average Rall's Ratio :  6.34
Average Bifurcation Angle Local :  76.61°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.9°
Fractal Dimension :  1.15

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