8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282731
Cell Name :  46_mod_T_F6M8_loom-dimm-RF_02
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1101tET
Structural Domains :  No Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  medulla
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  looming-detector
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  photo-activatable green fluorescent protein (pa-GFP)
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.01  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-18
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  46_mod_T_F6M8_loom-dimm-RF_02.pvec
Note :  This reconstruction is classified as periventricular interneuron (PVIN) in the original publication.

Reference Article
Related Article Reference :  Retinotectal circuitry of larval zebrafish is adapted to detection and pursuit of prey.

Measurements
Soma Surface :  391.98 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  37
Number of Branches :  75
Overall Width :  21.47 μm
Overall Height :  127.1 μm
Overall Depth :  25.75 μm
Average Diameter :  5.05 μm
Total Length :  553.4 μm
Total Surface :  9062.98 μm2
Total Volume :  12337.3 μm3
Max Euclidean Distance :  131.75 μm
Max Path Distance :  173.62 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  315
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.93
Average Bifurcation Angle Local :  95.7°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.24°
Fractal Dimension :  1.09

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