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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_71195
Cell Name :  43-SN-1
Archive Name :  Balleine
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  350 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  lipopolysaccharide injection + PXS-4681A
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-07-11
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  43-SN-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Inhibition of semicarbazide-sensitive amine oxidase/vascular adhesion protein-1 reduces lipopolysaccharide-induced neuroinflammation.

Measurements
Soma Surface :  393.34 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  97
Number of Branches :  199
Overall Width :  36.75 μm
Overall Height :  43.96 μm
Overall Depth :  10 μm
Average Diameter :  0.7 μm
Total Length :  842.03 μm
Total Surface :  1984.26 μm2
Total Volume :  550.25 μm3
Max Euclidean Distance :  33.11 μm
Max Path Distance :  78.72 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  1012
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  2.7
Average Bifurcation Angle Local :  101.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  101.04°
Fractal Dimension :  1.16

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