8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_80558
Cell Name :  41-smCx-1
Archive Name :  Anderson
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-12-22
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  41-smCx-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Loss of the neurodevelopmental gene Zswim6 alters striatal morphology and motor regulation.

Measurements
Soma Surface :  644.75 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  38
Overall Width :  151.41 μm
Overall Height :  285.05 μm
Overall Depth :  77.26 μm
Average Diameter :  1.4 μm
Total Length :  1473.75 μm
Total Surface :  6374.27 μm2
Total Volume :  2379.43 μm3
Max Euclidean Distance :  241.1 μm
Max Path Distance :  325.32 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  326
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  113.37°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.07°
Fractal Dimension :  1.04

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