8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_284717
Cell Name :  40x_Ms681_NoFlicker_1h_IBA1_07
Archive Name :  Prichard_Singer
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, right
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x , 40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2023-07-28
Date of Upload :  2024-07-30
Persistence Vector :  40x_Ms681_NoFlicker_1h_IBA1_07.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Brain rhythms control microglial response and cytokine expression via NF-κB signaling.

Measurements
Soma Surface :  608.64 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  43
Overall Width :  28.06 μm
Overall Height :  43.38 μm
Overall Depth :  41.99 μm
Average Diameter :  1.33 μm
Total Length :  296.15 μm
Total Surface :  1251.13 μm2
Total Volume :  471.01 μm3
Max Euclidean Distance :  33.71 μm
Max Path Distance :  50.46 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1725
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  47.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.88°
Fractal Dimension :  1.04

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