8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_284633
Cell Name :  40x_Ms678_NoFlicker_1h_IBA1_19
Archive Name :  Prichard_Singer
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  30 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, right
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x , 40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2023-07-28
Date of Upload :  2024-07-30
Persistence Vector :  40x_Ms678_NoFlicker_1h_IBA1_19.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Brain rhythms control microglial response and cytokine expression via NF-κB signaling.

Measurements
Soma Surface :  353.29 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  48
Overall Width :  23.79 μm
Overall Height :  60 μm
Overall Depth :  24.39 μm
Average Diameter :  1.51 μm
Total Length :  317.66 μm
Total Surface :  1516.57 μm2
Total Volume :  638.17 μm3
Max Euclidean Distance :  46.22 μm
Max Path Distance :  71.38 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  1597
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  38.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.04°
Fractal Dimension :  1.05

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