8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_273918
Cell Name :  401-C5-C1-x40
Archive Name :  Galvan
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 deltaC/deltaC
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  70.0 days
Max Age :  70.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  Biocytin, streptavidin-488
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2023-09-18
Date of Upload :  2023-09-28
Persistence Vector :  401-C5-C1-x40.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Age-related behavioural and striatal dysfunctions in Shank3ΔC/ΔC mouse model of autism spectrum disorder.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  51
Number of Branches :  104
Overall Width :  164.64 μm
Overall Height :  257.24 μm
Overall Depth :  17.02 μm
Average Diameter :  1.66 μm
Total Length :  4403.9 μm
Total Surface :  22957.8 μm2
Total Volume :  11459.5 μm3
Max Euclidean Distance :  174.47 μm
Max Path Distance :  485.19 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  13360
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  67.87°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.84°
Fractal Dimension :  1.03

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