8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_71192
Cell Name :  40-SN-2
Archive Name :  Balleine
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  350 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  lipopolysaccharide injection + PXS-4681A
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-07-11
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  40-SN-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Inhibition of semicarbazide-sensitive amine oxidase/vascular adhesion protein-1 reduces lipopolysaccharide-induced neuroinflammation.

Measurements
Soma Surface :  360.91 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  84
Number of Branches :  171
Overall Width :  30.08 μm
Overall Height :  48.91 μm
Overall Depth :  12 μm
Average Diameter :  0.63 μm
Total Length :  609.92 μm
Total Surface :  1255.53 μm2
Total Volume :  316.45 μm3
Max Euclidean Distance :  39.96 μm
Max Path Distance :  76.45 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  779
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  2.59
Average Bifurcation Angle Local :  102.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  95.25°
Fractal Dimension :  1.15

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