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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_271684
Cell Name :  4-39_2_B
Archive Name :  Seo
Species Name :  mouse
Strain :  P301S::ApoE3/ApoE3
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  280.0 days
Max Age :  280.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  molecular layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  GFAP-positive
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Germ-Free (GF)
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-09-04
Date of Upload :  2023-09-13
Persistence Vector :  4-39_2_B.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  ApoE isoform- and microbiota-dependent progression of neurodegeneration in a mouse model of tauopathy.

Measurements
Soma Surface :  12.38 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  56
Overall Width :  53.08 μm
Overall Height :  32.07 μm
Overall Depth :  5 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  317.37 μm
Total Surface :  249.26 μm2
Total Volume :  15.58 μm3
Max Euclidean Distance :  33.59 μm
Max Path Distance :  48.86 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  894
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  38.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  45.49°
Fractal Dimension :  1.05

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