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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_271720
Cell Name :  4-39_1_D
Archive Name :  Seo
Species Name :  mouse
Strain :  P301S::ApoE3/ApoE3
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  280.0 days
Max Age :  280.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  molecular layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  GFAP-positive
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Germ-Free (GF)
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-09-04
Date of Upload :  2023-09-13
Persistence Vector :  4-39_1_D.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  ApoE isoform- and microbiota-dependent progression of neurodegeneration in a mouse model of tauopathy.

Measurements
Soma Surface :  12.37 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  37
Overall Width :  48.52 μm
Overall Height :  27.53 μm
Overall Depth :  5 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  341.17 μm
Total Surface :  267.95 μm2
Total Volume :  16.75 μm3
Max Euclidean Distance :  31.73 μm
Max Path Distance :  38.72 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  933
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  40.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  42.52°
Fractal Dimension :  1.08

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