8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_112615
Cell Name :  3w_pi_AAV_Cre_GluN1KO_DG_4
Archive Name :  vonEngelhardt
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  rAAV-Syn-Cre-T2A-EGFP virus
Staining Method :  Biocytin + Alexa 594
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-01-22
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  3w_pi_AAV_Cre_GluN1KO_DG_4.pvec
Note :  Floxed GluN1 mouse line

Reference Article
Related Article Reference :  NMDA receptors mediate synaptic depression, but not spine loss in the dentate gyrus of adult amyloid Beta (Abeta) overexpressing mice.

Measurements
Soma Surface :  274.88 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  33
Overall Width :  117.77 μm
Overall Height :  242.54 μm
Overall Depth :  38.07 μm
Average Diameter :  1.55 μm
Total Length :  2051.5 μm
Total Surface :  10114.1 μm2
Total Volume :  4296.78 μm3
Max Euclidean Distance :  209.97 μm
Max Path Distance :  227.46 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1429
Partition Asymmetry :  0.27
Average Rall's Ratio :  2.12
Average Bifurcation Angle Local :  52.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  29.63°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website