8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282362
Cell Name :  396_1_1
Archive Name :  Rolemage
Species Name :  mouse
Strain :  Chat-IRES-Cre-neo
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  70.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  ventral pallidum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  cholinergic
Tertiary Cell Class :  projection, Appetitive odor activated
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  AAV + biocytin/streptavidin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2024-03-14
Date of Upload :  2024-03-21
Persistence Vector :  396_1_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Distinct subpopulations of ventral pallidal cholinergic projection neurons encode valence of olfactory stimuli.

Measurements
Soma Surface :  121.82 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  9
Overall Width :  8.85 μm
Overall Height :  121.09 μm
Overall Depth :  16.79 μm
Average Diameter :  0.92 μm
Total Length :  177.5 μm
Total Surface :  498.3 μm2
Total Volume :  239.13 μm3
Max Euclidean Distance :  90.57 μm
Max Path Distance :  100.14 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  610
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2.05
Average Bifurcation Angle Local :  109.4°
Average Bifurcation Angle Remote :  109.44°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website