8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107315
Cell Name :  389-01-06
Archive Name :  Martineau
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 6b, deep
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, ectopic
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  shRNA in utero electroporation targeting Dcx + GFP
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-16
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  389-01-06.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Correct Laminar Positioning in the Neocortex Influences Proper Dendritic and Synaptic Development.

Measurements
Soma Surface :  492.53 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  19
Overall Width :  273.74 μm
Overall Height :  394.17 μm
Overall Depth :  98 μm
Average Diameter :  0.05 μm
Total Length :  1398.57 μm
Total Surface :  223.34 μm2
Total Volume :  2.85 μm3
Max Euclidean Distance :  245.22 μm
Max Path Distance :  298.53 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  497
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  88.66°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.48°
Fractal Dimension :  1.04

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