8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108685
Cell Name :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_66
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  29 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_66.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  573.68 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  33
Number of Branches :  68
Overall Width :  156.29 μm
Overall Height :  194.97 μm
Overall Depth :  49.27 μm
Average Diameter :  1.62 μm
Total Length :  2674.85 μm
Total Surface :  11917 μm2
Total Volume :  6971.8 μm3
Max Euclidean Distance :  125.17 μm
Max Path Distance :  167.91 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  635
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.87
Average Bifurcation Angle Local :  98.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.63°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website