8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108684
Cell Name :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_58
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  29 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_58.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  486.7 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  71.63 μm
Overall Height :  96.97 μm
Overall Depth :  31.06 μm
Average Diameter :  2.12 μm
Total Length :  353.29 μm
Total Surface :  1955.66 μm2
Total Volume :  1845.67 μm3
Max Euclidean Distance :  90.34 μm
Max Path Distance :  104.24 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  79
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.68
Average Bifurcation Angle Local :  103.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  95.3°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website