8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108682
Cell Name :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_33
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  29 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_33.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  697.13 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  25
Overall Width :  136.85 μm
Overall Height :  179.61 μm
Overall Depth :  42.51 μm
Average Diameter :  1.75 μm
Total Length :  1327.52 μm
Total Surface :  6627.91 μm2
Total Volume :  4344.51 μm3
Max Euclidean Distance :  106.79 μm
Max Path Distance :  165.65 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  294
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.68
Average Bifurcation Angle Local :  81.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.62°
Fractal Dimension :  1.05

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