8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108681
Cell Name :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_2
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  zQ175 heterozygous
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  29 grams
Max Weight :  29 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  D2-type dopamine receptor-expressing
Original Format :  Vaa3D.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1000  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Vaa3D
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  3817_CPi_PHAL_Z001_app2_split_2.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  50.67 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  67
Overall Width :  101.77 μm
Overall Height :  155.77 μm
Overall Depth :  42.38 μm
Average Diameter :  1.84 μm
Total Length :  2452.58 μm
Total Surface :  12112.8 μm2
Total Volume :  8283.07 μm3
Max Euclidean Distance :  129.75 μm
Max Path Distance :  170.34 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  572
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.84
Average Bifurcation Angle Local :  85.79°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.59°
Fractal Dimension :  1.05

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