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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_71184
Cell Name :  38-SN-2-b
Archive Name :  Balleine
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  350 grams
Max Weight :  400 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  lipopolysaccharide injection + PXS-4681A
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-07-11
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  38-SN-2-b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Inhibition of semicarbazide-sensitive amine oxidase/vascular adhesion protein-1 reduces lipopolysaccharide-induced neuroinflammation.

Measurements
Soma Surface :  666.75 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  135
Number of Branches :  277
Overall Width :  38.81 μm
Overall Height :  59.93 μm
Overall Depth :  18.5 μm
Average Diameter :  0.53 μm
Total Length :  1158.11 μm
Total Surface :  2021.93 μm2
Total Volume :  387.51 μm3
Max Euclidean Distance :  50.26 μm
Max Path Distance :  123.66 μm
Max Branch Order :  24
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  1448
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2.78
Average Bifurcation Angle Local :  102.52°
Average Bifurcation Angle Remote :  103.37°
Fractal Dimension :  1.14

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