8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83317
Cell Name :  37_0005basal_redo
Archive Name :  Harland
Species Name :  rat
Strain :  PVG hooded
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 months
Max Age :  10.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  366 grams
Max Weight :  456 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Early training
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-10-16
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  37_0005basal_redo.pvec
Note :  Only basal dendrites traced

Reference Articles
Primary Article Reference :  Anterior thalamic nuclei lesions and recovery of function: Relevance to cognitive thalamus.
Secondary Article Reference :  Anterior thalamic lesions reduce spine density in both hippocampal CA1 and retrosplenial cortex, but enrichment rescues CA1 spines only.

Measurements
Soma Surface :  37.74 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  58
Overall Width :  181.15 μm
Overall Height :  116.53 μm
Overall Depth :  124.58 μm
Average Diameter :  1.35 μm
Total Length :  2967.41 μm
Total Surface :  12419.4 μm2
Total Volume :  4199.33 μm3
Max Euclidean Distance :  164.46 μm
Max Path Distance :  191.86 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  805
Partition Asymmetry :  0.31
Average Rall's Ratio :  1.64
Average Bifurcation Angle Local :  73.65°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.83°
Fractal Dimension :  1.02

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