8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83481
Cell Name :  3669_2737_274
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-06-13
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  3669_2737_274.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  webKnossos: efficient online 3D data annotation for connectomics.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  10
Overall Width :  16.96 μm
Overall Height :  56.86 μm
Overall Depth :  13.36 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  154.52 μm
Total Surface :  242.72 μm2
Total Volume :  30.34 μm3
Max Euclidean Distance :  47.93 μm
Max Path Distance :  70.07 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.74
Total Fragmentation :  915
Partition Asymmetry :  0.8
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  137.79°
Average Bifurcation Angle Remote :  121.95°
Fractal Dimension :  1.15

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