8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_50831
Cell Name :  35dpi_ipsi_infra_06
Archive Name :  Beining
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  4.2 months
Gender :  Male
Min Weight :  220 grams
Max Weight :  450 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, infrapyramidal blade
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  adult-born
Original Format :  Trees Toolbox.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Stimulated
Staining Method :  green fluorescent protein, Alexa Fluor 488, immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  TREES toolbox
Date of Deposition :  2016-01-16
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  35dpi_ipsi_infra_06.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult-born dentate granule cells show a critical period of dendritic reorganization and are distinct from developmentally born cells.

Measurements
Soma Surface :  240.03 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  23
Overall Width :  190.16 μm
Overall Height :  298.01 μm
Overall Depth :  131.9 μm
Average Diameter :  0.78 μm
Total Length :  2598.66 μm
Total Surface :  6380.06 μm2
Total Volume :  1505.37 μm3
Max Euclidean Distance :  364.5 μm
Max Path Distance :  398.03 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2615
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  50.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  33.4°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website