8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_83473
Cell Name :  3483_9016_1463
Archive Name :  Helmstaedter
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.nml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-06-13
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  3483_9016_1463.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  webKnossos: efficient online 3D data annotation for connectomics.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  6
Overall Width :  11.45 μm
Overall Height :  73.6 μm
Overall Depth :  4.36 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  111.57 μm
Total Surface :  175.25 μm2
Total Volume :  21.91 μm3
Max Euclidean Distance :  46.24 μm
Max Path Distance :  62.37 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.67
Total Fragmentation :  588
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  84.38°
Average Bifurcation Angle Remote :  119.32°
Fractal Dimension :  1.27

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