8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_82887
Cell Name :  31-r3z
Archive Name :  Greggio
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6 LRRK2-/- Knock-out
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2017-11-08
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  31-r3z.pvec
Note :  GFP injection: anteroposterior 0.5 mm; lateral 2.0 mm

Reference Article
Related Article Reference :  Leucine-rich repeat kinase 2 interacts with p21-activated kinase 6 to control neurite complexity in mammalian brain.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  32
Overall Width :  130.65 μm
Overall Height :  97.6 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  749.17 μm
Total Surface :  1461.58 μm2
Total Volume :  226.91 μm3
Max Euclidean Distance :  94.59 μm
Max Path Distance :  160.31 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  236
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  66.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.99°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website