8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_168221
Cell Name :  304_1JZb
Archive Name :  Zorrilla_Bacci
Species Name :  mouse
Strain :  B6EiC3Sn BLiA-Ts(1716)65Dn/DnJ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Down Syndrome trisomic
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-08-30
Date of Upload :  2021-11-17
Persistence Vector :  304_1JZb.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from a crossed mouse (Ts65Dn Jax stock #5252 crossed with X98GFP Jackson #6340).

Reference Article
Related Article Reference :  Alterations of specific cortical GABAergic circuits underlie abnormal network activity in a mouse model of Down syndrome.

Measurements
Soma Surface :  632.63 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  12
Overall Width :  129.23 μm
Overall Height :  265.73 μm
Overall Depth :  25.31 μm
Average Diameter :  0.9 μm
Total Length :  767.88 μm
Total Surface :  2171.14 μm2
Total Volume :  488.51 μm3
Max Euclidean Distance :  243.62 μm
Max Path Distance :  305.15 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  448
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  82.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.18°
Fractal Dimension :  1.04

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