8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_168198
Cell Name :  304_1JZa
Archive Name :  Zorrilla_Bacci
Species Name :  mouse
Strain :  B6EiC3Sn BLiA-Ts(1716)65Dn/DnJ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  25.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  medial prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Down Syndrome trisomic
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-08-30
Date of Upload :  2021-11-17
Persistence Vector :  304_1JZa.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from a crossed mouse (Ts65Dn Jax stock #5252 crossed with X98GFP Jackson #6340).

Reference Article
Related Article Reference :  Alterations of specific cortical GABAergic circuits underlie abnormal network activity in a mouse model of Down syndrome.

Measurements
Soma Surface :  759.72 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  41
Overall Width :  377.92 μm
Overall Height :  702.51 μm
Overall Depth :  34.4 μm
Average Diameter :  0.9 μm
Total Length :  2567.62 μm
Total Surface :  7259.78 μm2
Total Volume :  1633.45 μm3
Max Euclidean Distance :  536.1 μm
Max Path Distance :  620.88 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  1994
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  88.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.76°
Fractal Dimension :  1.05

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