8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_275627
Cell Name :  30398_S5_L5-000
Archive Name :  Ciganok-Huckels_Jehasse_Kampa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  12.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-08-29
Date of Upload :  2024-02-15
Persistence Vector :  30398_S5_L5-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Postnatal development of electrophysiological and morphological properties in layer 2/3 and layer 5 pyramidal neurons in the mouse primary visual cortex.

Measurements
Soma Surface :  17.66 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  54
Number of Branches :  113
Overall Width :  204.39 μm
Overall Height :  542.37 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  3445.98 μm
Total Surface :  2706.46 μm2
Total Volume :  169.15 μm3
Max Euclidean Distance :  520.28 μm
Max Path Distance :  639.48 μm
Max Branch Order :  23
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  4083
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  36.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.06°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website