8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_159683
Cell Name :  3-Som-3d-trace
Archive Name :  Adke_Carrasquillo
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  63.0 days
Max Age :  119.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  central
Tertiary Brain Region :  right
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-07-06
Date of Upload :  2021-07-20
Persistence Vector :  3-Som-3d-trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cell-Type Specificity of Neuronal Excitability and Morphology in the Central Amygdala.

Measurements
Soma Surface :  554.87 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  21
Overall Width :  146.66 μm
Overall Height :  181.59 μm
Overall Depth :  94.54 μm
Average Diameter :  0.82 μm
Total Length :  1146.24 μm
Total Surface :  3084.22 μm2
Total Volume :  727.9 μm3
Max Euclidean Distance :  168.15 μm
Max Path Distance :  196.42 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1144
Partition Asymmetry :  0.29
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  57.99°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.24°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website