8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_177237
Cell Name :  3-CTR_Female_Nac_4
Archive Name :  Gaspar
Species Name :  rat
Strain :  Han Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  nucleus accumbens
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  1000x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2022-01-06
Date of Upload :  2022-01-28
Persistence Vector :  3-CTR_Female_Nac_4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Resilience to stress and sex-specific remodeling of microglia and neuronal morphology in a rat model of anxiety and anhedonia.

Measurements
Soma Surface :  210.88 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  96
Number of Branches :  197
Overall Width :  63.71 μm
Overall Height :  50 μm
Overall Depth :  24 μm
Average Diameter :  0.13 μm
Total Length :  1061.95 μm
Total Surface :  433.71 μm2
Total Volume :  14.1 μm3
Max Euclidean Distance :  42.29 μm
Max Path Distance :  88.16 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  513
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  108.35°
Average Bifurcation Angle Remote :  103.28°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website