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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_139150
Cell Name :  3-7_2
Archive Name :  Siemsen
Species Name :  rat
Strain :  Long-Evans
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  prelimbic
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.imx
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  lipopolysaccharide injection
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-05-18
Date of Upload :  2020-09-01
Persistence Vector :  3-7_2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chronic intermittent ethanol and lipopolysaccharide exposure differentially alter Iba1-derived microglia morphology in the prelimbic cortex and nucleus accumbens core of male Long-Evans rats.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  132
Number of Branches :  266
Overall Width :  27.22 μm
Overall Height :  48.81 μm
Overall Depth :  37.41 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  863.9 μm
Total Surface :  678.51 μm2
Total Volume :  42.41 μm3
Max Euclidean Distance :  35.6 μm
Max Path Distance :  64.7 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  6492
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  95.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.65°
Fractal Dimension :  1.05

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