8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_167887
Cell Name :  3-6-5-Neuron
Archive Name :  Bergstrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  23.6 grams
Max Weight :  34.4 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  antimicrobial regimen
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-01
Date of Upload :  2021-11-11
Persistence Vector :  3-6-5-Neuron.pvec
Note :  The animal was administered with 2 mg/ml neomycin; 2 mg/ml bacitracin; 1.2 microg/ml pimaricin in tap water for 10 days

Reference Article
Related Article Reference :  Sex differences in gut microbiota modulation of aversive conditioning, open field activity, and basolateral amygdala dendritic spine density.

Measurements
Soma Surface :  1031.1 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  29
Overall Width :  260 μm
Overall Height :  234.74 μm
Overall Depth :  54.05 μm
Average Diameter :  1.39 μm
Total Length :  1918.58 μm
Total Surface :  8594.28 μm2
Total Volume :  3503.22 μm3
Max Euclidean Distance :  219.68 μm
Max Path Distance :  251.56 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1972
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.25
Average Bifurcation Angle Local :  82.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.09°
Fractal Dimension :  1.03

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