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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_140398
Cell Name :  3-4-1_1
Archive Name :  Lee_LJ
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  84.0 days
Max Age :  84.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  molecular layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  sleep deprivation (SD)
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-09-13
Date of Upload :  2020-10-06
Persistence Vector :  3-4-1_1.pvec
Note :  SD for 72h was induced using a modified multiple-platform method in a water tank.

Reference Article
Related Article Reference :  Microglia-mediated synaptic pruning is impaired in sleep-deprived adolescent mice.

Measurements
Soma Surface :  138.42 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  46
Overall Width :  45.94 μm
Overall Height :  39.38 μm
Overall Depth :  9 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  381.84 μm
Total Surface :  299.9 μm2
Total Volume :  18.74 μm3
Max Euclidean Distance :  37.45 μm
Max Path Distance :  61.57 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.74
Total Fragmentation :  611
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  106.4°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.65°
Fractal Dimension :  1.13

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