8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_98587
Cell Name :  3-22-2016-sl2-tracing
Archive Name :  Danzer
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.2 months
Max Age :  8.2 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  PTEN Knockout
Staining Method :  Streptavidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-25
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  3-22-2016-sl2-tracing.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  PTEN deletion increases hippocampal granule cell excitability in male and female mice.

Measurements
Soma Surface :  547.19 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  65
Overall Width :  206.48 μm
Overall Height :  339.76 μm
Overall Depth :  61.48 μm
Average Diameter :  0.27 μm
Total Length :  3356.4 μm
Total Surface :  3080.87 μm2
Total Volume :  254.2 μm3
Max Euclidean Distance :  265.62 μm
Max Path Distance :  330.65 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  826
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.89
Average Bifurcation Angle Local :  48.07°
Average Bifurcation Angle Remote :  33.28°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website