8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_98585
Cell Name :  3-16-2016-tracing
Archive Name :  Danzer
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.2 months
Max Age :  8.2 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  PTEN Knockout
Staining Method :  Streptavidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-07-25
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  3-16-2016-tracing.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  PTEN deletion increases hippocampal granule cell excitability in male and female mice.

Measurements
Soma Surface :  725.73 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  25
Number of Branches :  52
Overall Width :  154.14 μm
Overall Height :  194.8 μm
Overall Depth :  33 μm
Average Diameter :  0.45 μm
Total Length :  2228.07 μm
Total Surface :  3149.85 μm2
Total Volume :  354.36 μm3
Max Euclidean Distance :  227.44 μm
Max Path Distance :  249.87 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  464
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  64.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  36.79°
Fractal Dimension :  1.02

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