8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_140405
Cell Name :  3-1-2_5
Archive Name :  Lee_LJ
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  84.0 days
Max Age :  84.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  molecular layer
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-09-13
Date of Upload :  2020-10-06
Persistence Vector :  3-1-2_5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Microglia-mediated synaptic pruning is impaired in sleep-deprived adolescent mice.

Measurements
Soma Surface :  243.1 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  52
Overall Width :  46.99 μm
Overall Height :  28.76 μm
Overall Depth :  5.97 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  334.97 μm
Total Surface :  263.09 μm2
Total Volume :  16.44 μm3
Max Euclidean Distance :  36.26 μm
Max Path Distance :  55.96 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  498
Partition Asymmetry :  0.72
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  94.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.96°
Fractal Dimension :  1.11

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website