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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08271
Cell Name :  2invivo-1
Archive Name :  Long
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-03-15
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  2invivo-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Myo9b and RICS Modulate Dendritic Morphology of Cortical Neurons.

Measurements
Soma Surface :  528.62 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  11
Overall Width :  37.61 μm
Overall Height :  90.44 μm
Overall Depth :  13.63 μm
Average Diameter :  0.23 μm
Total Length :  211.18 μm
Total Surface :  152.59 μm2
Total Volume :  8.77 μm3
Max Euclidean Distance :  70.14 μm
Max Path Distance :  74.88 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  30
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  72.06°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.06°
Fractal Dimension :  1.02

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