8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_61461
Cell Name :  296_080612AL2-ID_JH
Archive Name :  Staiger
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  32.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  bursting, initial doublet
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-18
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  296_080612AL2-ID_JH.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological Characteristics of Electrophysiologically Characterized Layer Vb Pyramidal Cells in Rat Barrel Cortex.

Measurements
Soma Surface :  2354.08 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  145
Number of Branches :  297
Overall Width :  855.44 μm
Overall Height :  1460.8 μm
Overall Depth :  185.68 μm
Average Diameter :  0.74 μm
Total Length :  26857.8 μm
Total Surface :  59607.4 μm2
Total Volume :  24723.1 μm3
Max Euclidean Distance :  1047.99 μm
Max Path Distance :  1798.99 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  14473
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  77.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.87°
Fractal Dimension :  1.06

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