8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_129611
Cell Name :  28_ch
Archive Name :  Huh
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  112.0 days
Max Age :  142.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  lateral geniculate nucleus
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  thalamocortical
Tertiary Cell Class :  relay, primary visual cortex projecting
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-02-07
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  28_ch.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Long-term Monocular Deprivation during Juvenile Critical Period Disrupts Binocular Integration in Mouse Visual Thalamus.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  92
Number of Branches :  185
Overall Width :  205.31 μm
Overall Height :  104.01 μm
Overall Depth :  3.87 μm
Average Diameter :  1.45 μm
Total Length :  1868.48 μm
Total Surface :  8818.42 μm2
Total Volume :  3476.25 μm3
Max Euclidean Distance :  144.74 μm
Max Path Distance :  312.74 μm
Max Branch Order :  28
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  905
Partition Asymmetry :  0.66
Average Rall's Ratio :  2.03
Average Bifurcation Angle Local :  115.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  108°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website