8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_273905
Cell Name :  288-K-C1-x40
Archive Name :  Galvan
Species Name :  mouse
Strain :  Shank3 deltaC/deltaC
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  140.0 days
Max Age :  140.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Shank3 knockout
Staining Method :  Biocytin, streptavidin-488
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2023-09-18
Date of Upload :  2023-09-28
Persistence Vector :  288-K-C1-x40.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Age-related behavioural and striatal dysfunctions in Shank3ΔC/ΔC mouse model of autism spectrum disorder.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  66
Overall Width :  191.98 μm
Overall Height :  318.12 μm
Overall Depth :  53.93 μm
Average Diameter :  1.01 μm
Total Length :  2993.14 μm
Total Surface :  9477.44 μm2
Total Volume :  2478.38 μm3
Max Euclidean Distance :  222.13 μm
Max Path Distance :  243.76 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  9558
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.99
Average Bifurcation Angle Local :  69.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.16°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website