8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_59689
Cell Name :  27_02_04_1Wag
Archive Name :  Kole
Species Name :  rat
Strain :  WAG/Rij
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  40.0 days
Max Age :  140.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, hindlimb representation, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-12-16
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  27_02_04_1Wag.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Inherited cortical HCN1 channel loss amplifies dendritic calcium electrogenesis and burst firing in a rat absence epilepsy model.

Measurements
Soma Surface :  1684.74 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  51
Number of Branches :  114
Overall Width :  321.83 μm
Overall Height :  1202.83 μm
Overall Depth :  152.77 μm
Average Diameter :  1.28 μm
Total Length :  11315.3 μm
Total Surface :  47524.7 μm2
Total Volume :  23957.5 μm3
Max Euclidean Distance :  1067.4 μm
Max Path Distance :  1379.71 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  16610
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.48
Average Bifurcation Angle Local :  78.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.11°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website