8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_61459
Cell Name :  262_080425AL1-IB_JH
Archive Name :  Staiger
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  32.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  bursting, high-threshold
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-18
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  262_080425AL1-IB_JH.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological Characteristics of Electrophysiologically Characterized Layer Vb Pyramidal Cells in Rat Barrel Cortex.

Measurements
Soma Surface :  2034.77 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  121
Number of Branches :  251
Overall Width :  1428.61 μm
Overall Height :  1766.18 μm
Overall Depth :  169.28 μm
Average Diameter :  0.68 μm
Total Length :  26253 μm
Total Surface :  60149.1 μm2
Total Volume :  19780.4 μm3
Max Euclidean Distance :  1393.53 μm
Max Path Distance :  1840.31 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.74
Total Fragmentation :  16512
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.53
Average Bifurcation Angle Local :  78.66°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.47°
Fractal Dimension :  1.08

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