8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282969
Cell Name :  25_mod_T_160725_F3M8_loom-dimm_02
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1101tET
Structural Domains :  No Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  periventricular layer
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  looming-detector
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  photo-activatable green fluorescent protein (pa-GFP)
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.01  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-18
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  25_mod_T_160725_F3M8_loom-dimm_02.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Retinotectal circuitry of larval zebrafish is adapted to detection and pursuit of prey.

Measurements
Soma Surface :  461.81 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  29
Overall Width :  30.77 μm
Overall Height :  56.51 μm
Overall Depth :  23.02 μm
Average Diameter :  4.69 μm
Total Length :  523.3 μm
Total Surface :  8077.85 μm2
Total Volume :  10480.8 μm3
Max Euclidean Distance :  61.99 μm
Max Path Distance :  152.27 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.68
Total Fragmentation :  310
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.77
Average Bifurcation Angle Local :  97.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.71°
Fractal Dimension :  1.2

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