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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117408
Cell Name :  25_16
Archive Name :  Banerjee
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Effective RNF2 RNAi
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-06-10
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  25_16.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Modulation of hippocampal synapse maturation by activity-regulated E3 ligase via non-canonical pathway.

Measurements
Soma Surface :  628.01 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  97
Number of Branches :  196
Overall Width :  60.03 μm
Overall Height :  92.99 μm
Overall Depth :  0.3 μm
Average Diameter :  0.2 μm
Total Length :  781.47 μm
Total Surface :  746.09 μm2
Total Volume :  171.15 μm3
Max Euclidean Distance :  84.89 μm
Max Path Distance :  116.84 μm
Max Branch Order :  29
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  3978
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  1.88
Average Bifurcation Angle Local :  67.51°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.93°
Fractal Dimension :  1.14

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