8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_84620
Cell Name :  24849
Archive Name :  Jekely
Species Name :  Clam worm
Strain :  Platynereis dumerilii
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  eye circuit
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  anterior
Primary Cell Class :  sensory
Secondary Cell Class :  photoreceptor
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunogold
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.05  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2017-06-30
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  24849.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  Neuronal connectome of a sensory-motor circuit for visual navigation.
Secondary Article Reference :  Inter-individual stereotypy of the Platynereis larval visual connectome.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  34
Overall Width :  15.41 μm
Overall Height :  21.17 μm
Overall Depth :  30.48 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  88.13 μm
Total Surface :  138.44 μm2
Total Volume :  17.3 μm3
Max Euclidean Distance :  34.05 μm
Max Path Distance :  58.67 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  613
Partition Asymmetry :  0.87
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  106.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  106.43°
Fractal Dimension :  1.24

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website