8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_113935
Cell Name :  23_den_ax
Archive Name :  Lin_Zhang
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  56.0 days
Max Age :  60.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  secondary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Amira.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  AAV + eGFP
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  1  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected (no values given)
Objective Type :  water
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2019-02-12
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  23_den_ax.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Reconstruction of Intratelencephalic Neurons in the Mouse Secondary Motor Cortex Reveals the Diverse Projection Patterns of Single Neurons.

Measurements
Soma Surface :  93.48 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  588
Number of Branches :  1182
Overall Width :  4006.89 μm
Overall Height :  3178.32 μm
Overall Depth :  3352.36 μm
Average Diameter :  0.46 μm
Total Length :  85147.8 μm
Total Surface :  123050 μm2
Total Volume :  14150.7 μm3
Max Euclidean Distance :  6088.14 μm
Max Path Distance :  7350.37 μm
Max Branch Order :  44
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  135859
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  66.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.44°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website