8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_61457
Cell Name :  229_080211AL2-IB_JH
Archive Name :  Staiger
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  19.0 days
Max Age :  32.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  bursting, high-threshold
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-18
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  229_080211AL2-IB_JH.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological Characteristics of Electrophysiologically Characterized Layer Vb Pyramidal Cells in Rat Barrel Cortex.

Measurements
Soma Surface :  2295 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  136
Number of Branches :  280
Overall Width :  1536.04 μm
Overall Height :  2145.14 μm
Overall Depth :  167.18 μm
Average Diameter :  0.66 μm
Total Length :  28454.8 μm
Total Surface :  65022.6 μm2
Total Volume :  19972.6 μm3
Max Euclidean Distance :  1419.32 μm
Max Path Distance :  1906.26 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  17187
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  74.83°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.2°
Fractal Dimension :  1.09

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