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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_191023
Cell Name :  223417-6mo-GFAP-IFN-20x-cerebellum-iba1-2
Archive Name :  West_Hofer
Species Name :  mouse
Strain :  GFAP-IFN
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  interferon (IFN-alpha) chronic production
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-05-20
Date of Upload :  2022-06-23
Persistence Vector :  223417-6mo-GFAP-IFN-20x-cerebellum-iba1-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The cytokines interleukin-6 and interferon-α induce distinct microglia phenotypes.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  58
Overall Width :  28.38 μm
Overall Height :  69.29 μm
Overall Depth :  48.75 μm
Average Diameter :  1.89 μm
Total Length :  530.25 μm
Total Surface :  3124.25 μm2
Total Volume :  1664.37 μm3
Max Euclidean Distance :  67.1 μm
Max Path Distance :  84.75 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1361
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  75.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.35°
Fractal Dimension :  1.02

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