8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_51668
Cell Name :  220F-REM_7_tracing
Archive Name :  Smith_Cowan
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  27 grams
Max Weight :  32 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  ventral striatum
Tertiary Brain Region :  nucleus accumbens, shell
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Fmr1 knockout
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-04
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  220F-REM_7_tracing.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Fragile X mental retardation protein regulates synaptic and behavioral plasticity to repeated cocaine administration.

Measurements
Soma Surface :  615.92 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  23
Overall Width :  122.31 μm
Overall Height :  157.26 μm
Overall Depth :  56.52 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1246.46 μm
Total Surface :  3915.88 μm2
Total Volume :  978.97 μm3
Max Euclidean Distance :  133.05 μm
Max Path Distance :  168.67 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  350
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  81.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.43°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website