8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_50721
Cell Name :  21dpi_ipsi_infra_06
Archive Name :  Beining
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  3.8 months
Gender :  Male
Min Weight :  220 grams
Max Weight :  450 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, infrapyramidal blade
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  adult-born
Original Format :  Trees Toolbox.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Stimulated
Staining Method :  green fluorescent protein, Alexa Fluor 488, immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  TREES toolbox
Date of Deposition :  2016-01-16
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  21dpi_ipsi_infra_06.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult-born dentate granule cells show a critical period of dendritic reorganization and are distinct from developmentally born cells.

Measurements
Soma Surface :  209.07 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  19
Overall Width :  110.56 μm
Overall Height :  287.29 μm
Overall Depth :  127.5 μm
Average Diameter :  0.94 μm
Total Length :  1868.46 μm
Total Surface :  5518.23 μm2
Total Volume :  1411.35 μm3
Max Euclidean Distance :  314.35 μm
Max Path Distance :  344.38 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1885
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  42.16°
Average Bifurcation Angle Remote :  24.88°
Fractal Dimension :  1.01

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