8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_50708
Cell Name :  21dpi_contra_infra_02
Archive Name :  Beining
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.5 months
Max Age :  3.8 months
Gender :  Male
Min Weight :  220 grams
Max Weight :  450 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer, suprapyramidal blade
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  adult-born
Original Format :  Trees Toolbox.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein, Alexa Fluor 488, immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  TREES toolbox
Date of Deposition :  2016-01-16
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  21dpi_contra_infra_02.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adult-born dentate granule cells show a critical period of dendritic reorganization and are distinct from developmentally born cells.

Measurements
Soma Surface :  203.47 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  25
Overall Width :  160.32 μm
Overall Height :  308.63 μm
Overall Depth :  130.58 μm
Average Diameter :  1.01 μm
Total Length :  2300.11 μm
Total Surface :  7305.06 μm2
Total Volume :  2034.06 μm3
Max Euclidean Distance :  355.21 μm
Max Path Distance :  373.16 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  2315
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  47.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  30.34°
Fractal Dimension :  1.01

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